La tant désirée licence pour construire sur le lieux une Eglise à la mémoire de la glorieuse Apparition obtenue par les habitants d'Ardesio, la commune, dans son « conseil » datant du 13 janvier 1608, délibéra la somme de 4300 lire impérial pour payer la maison de Marco Salera et d'autres voisines qui furent démolies, à l'exception de la pièce des Images qui fut gardée intacte pour y créer la Chapelle Majeure de l'Eglise.

Il Santuario

Le 24 juin 1608, pendant une procession solennelle, avec le curé don Gaffuri, on posa le première pierre. Incorporée à celle-ci, une plaque de plomb portait cette inscription:
«Le jour du 24 juin 1608, sous le Pape Paul V, le Doge de Venise Leonardo Donati et l'Eveque de Bergame Giovanni Battista Milani, la première pierre de cette Eglise est posée par la main du Sacerdoce Andrea Gaffuri, curé du village ».
Les travaux de construction continuèrent avec soin. La commune mis à disposition ses forêts et d'autres fonds pour payer la main d'ouvre des ouvriers. A plusieurs reprises se répétèrent des délibérations du conseil pour la concession de différents permis. La motivation était toujours la même, et approuvée à l'unanimité, formulée comme cela:
« Afin que la Vierge Marie intervienne auprès de Dieu en faveur de la commune ».
La population offrit sa collaboration en donnant une journée de travaille à tour de rôle. La construction fut accélérée au point que le 5 août 1608, la chapelle de l'autel majeur finie, on y célébra la première messe et de suite solennellement une seconde par l'Archiprêtre de Clusone. Cette date fut la festivité la plus grande du Sanctuaire jusqu'en 1691, année où avec la délibération public, les travaux de construction étant de plus fini, on établi de fêter la date du 23 juin de chaque année, anniversaire de l'Apparition. Le Pape Paul V avec un écrit du 27 janvier 1609 concéda l'indulgence plénière à qui visitait le Sanctuaire le jour de l'Annonciation de la Sainte Vierge Marie (la célébration du 23 juin n'était pas encore fixé) et priait pour la concorde des principes chrétiens, l'extinction des hérésies et l'exaltation de la Sainte Mère Eglise. Avec un autre écrit du 29 juillet 1617, le même pontife Paul V ordonna que l'Eglise des miracles aie une administration autonome, qu'elle ne vienne jamais lier à aucun bénéfices ecclésiastique, et que l'administration de tous les biens, de quelque nature qu'ils soient ou d'où qu'il viennent, restent toujours en main des hommes de cette terre. Il devraient seulement en rendre compte à l'Evêque chaque année. (les deux écrits sont conservés dans l'archive du Sanctuaire). Ces documents démontre non seulement la prompt intervention de l'autorité ecclésiastique, mais sont aussi la preuve de la véracité historique des faits cités.

Le clocher

En 1645 on débuta la construction du clocher qui se conclut environ vingt ans après avec la dépense de vingt mille écu. On utilisa du marbre local fournit par la carrière qui encore aujourd'hui est appelée la « Corna della Madonna ». Ce clocher atteint une hauteur de 68 mètres avec une élégante ligne architectonique qui le rend un des plus admiré du diocèse. La construction de la structure fut confiée à l'architecte Giovmaria Bettera de Gandino qui fut aussi l'auteur du dessin approuvé à l'unanimité.
Il est dit que le Card. Carrara à la vue du clocher, afferma en présence de l'évêque de Bergame Mons. Paolo Dolfin : « je n'ai jamais vu une chose plus solide et plus élégante au dehors des portes de Rome ». Les huit cloches en Ré Bémol majeur classique qui saluent les pèlerins furent fusées à la Fonderie Crespi de Crema en 1780.